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细胞记忆与决定：胞外信号分子作用时间短，单细胞可以储存这些记忆，使细胞向特定方向分化。果蝇的成虫盘移植实验便是一个很好地列子。细胞记忆使得细胞在其形态、结构和功能等分化特征尚未表现出来就已经确定了细胞的分化命运，这就是细胞决定。
胞外信号分子
①近端组织的相互作用：
又叫做胚胎诱导,指细胞分泌信号分子旁泌素,影响周围细胞想一定方向分化.如：眼的发生.已知正常情况下,视泡诱导与其接触的外胚层发育为晶状体,实验证明,把视泡移植到其他部位后也能够诱导与之接触的外胚层发育为晶状体.
②远距离细胞的相互作用
通过激素进行调节,如：蝌蚪变态过程中,会分泌大量甲状腺素和三碘甲状腺原氨酸.
受精卵细胞质的不均一性
母体效应：卵母细胞中贮存的mRNA和蛋白质的分布是不均匀的,各种mRNA在细胞中都定位分布,在细胞分裂时mRNA不均一的分配到子细胞中,从而决定细胞分化的命运.
细胞间的相互作用与位置效应
实验证明,改变细胞所处的位置可导致细胞分化方向的改变.此即位置效应
环境对性别的决定
很多爬行动物通过与环境的作用决定其性别.
染色质变化与基因重排对细胞分化的影响
染色质变化主要包括：基因丢失,基因扩增,基因重排,DNA甲基化
基因丢失：细胞发育过程中出现染色体数量减少或者某一部分丢失的现象.如蛔虫发育过程
基因扩增：细胞内特定基因拷贝数在某一时期大量增加的现象.如卵母细胞rDNA扩增以及双翅目昆虫体细胞内的多线染色体.
基因重排：基因与基因间的位置或顺序发生重新排列组合.如B淋巴细胞分化为浆细胞的过程中,它的DNA经过断裂重排的变化,这有利于其利用有限的免疫球蛋白基因表达大量的抗体.
DNA甲基化：DNA上某些序列处的胞嘧啶被甲基化而引起基因失活.
总之伴随染色质变化,细胞分化也出现变化.
（补充）数量效应：细胞数量对诱导组织形成是必要的
如小鼠胚胎胰腺原基在体外进行组织培养时,可发育成具有功能的胰腺组织,但如果把胰原基切成8小块分别培养,则都不能形成胰腺组织,如果再把分开的小块合起来,又可形成胰腺组织。