核糖体主要由核糖体RNA(rRNA)及数十种不同的核糖体蛋白质组成。核糖体蛋白和rRNA被排列成大小亚基。
原核生物的核糖体直径约为20nm,由65%rRNA和35%核糖体蛋白组成。细菌70S核糖体由50S和30S亚基组成。30S小亚基含有16SRNA(1540个核苷酸)和21种核糖体蛋白质;大亚基由5SRNA(120个核苷酸)、23SRNA(2900个核苷酸)及31个核糖体蛋白组成。
真核生物核糖体的直径在25到30nm之间,rRNA与蛋白质的比率接近1。真核生物的核糖体80S核糖体定位于其胞质。每个核糖体由40S小亚基和60S大亚基组成。
40S亚基具有18SRNA(1900个核苷酸)和33个蛋白质。60S大亚基由5SRNA(120个核苷酸)、28SRNA(4700个核苷酸)、5.8SRNA(160个核苷酸)和46个核糖体蛋白组成。
真核生物中,定位于线粒体中的核糖体称为线粒体核糖体,定位于质体的核糖体称为质体核糖体,如定位于叶绿体中的叶绿体核糖体。它们也是由大小亚基与蛋白质结合的一个70S核糖体,与细菌类似。
核糖体的主要功能是将遗传密码转换成氨基酸序列并从氨基酸单体构建蛋白质聚合物。具体来说,mRNA包含一系列密码子,核糖体以mRNA作为模板,通过移动穿过mRNA的每个密码子(3个核苷酸),将其与氨酰基-tRNA提供的适当氨基酸配对。
氨基酰基-tRNA的一端含有与密码子互补的反密码子,另一端携有适当的氨基酸。核糖体利用大的构象变化快速准确地识别合适的tRNA。通常与含有第一个氨基酸甲硫氨酸的氨酰基-tRNA结合的核糖体小亚基与AUG密码子结合,并招募核糖体大亚基。核糖体含有三个RNA结合位点:即A、P和E位点。
A位点结合氨酰基-tRNA或终止释放因子;P-位点结合肽基-tRNA(与tRNA结合的tRNA)多肽链;E位点(出口)结合游离tRNA。蛋白质合成始于mRNA5'末端附近的起始密码子AUG。mRNA与核糖体的P位点结合。
核糖体通过使用原核生物中的mRNA的Shine-Dalgarno序列和真核生物中的Kozak盒来识别起始密码子。
核糖体积极参与蛋白质折叠。在某些情况下,核糖体对于获得功能性蛋白质至关重要。深度打结蛋白质的折叠依赖于核糖体将链条推过附着的环。
核糖体质量控制蛋白Rqc2的存在与mRNA非依赖性的蛋白质多肽链的延伸相关。这种延伸是核糖体通过Rqc2带来的tRNA添加CAT尾部的结果。
核糖体在肽基转移和肽基水解这两个极其重要的生物过程中起催化作用。